东莞和深圳都是经济发达的地区，注册公司的优势和劣势也有所不同。东莞的优势在于营业税率低、办理程序简单，而深圳的优势在于资源丰富、政策优惠。然而，两地注册公司的终选择，还是要根据企业的实际情况来确定。
一、东莞注册公司优势
1、营业税率低。东莞是中国经济发达的城市，营业税率低，营业税率只有3%，比深圳低得多，可以为企业节省大量的费用。
2、办理程序简单。东莞的公司注册程序简单，不需要太多的文件，只需要准备好一些基本的资料就可以完成注册手续，节省了企业的时间和精力。
二、深圳注册公司优势
1、资源丰富。深圳是中国经济发达的城市之一，资源丰富，可以为企业提供更多的服务，比如技术支持、财务服务等。
2、政策优惠。深圳的政策优惠，比如税收优惠、金融支持等，可以为企业提供更多的发展机会，让企业更容易发展壮大。
三、两地公司注册的比较
从上面的分析可以看出，东莞和深圳注册公司各有优势，但终选择还是要根据企业的实际情况来确定。如果企业规模较小，可以考虑东莞，因为营业税率低，办理程序简单；如果企业规模较大，可以考虑深圳，因为资源丰富，政策优惠。
总之，东莞和深圳注册公司的优势和劣势各有不同，终的选择要根据企业的实际情况来确定，才能使企业发展得更好。