在深圳注册公司时，除了上述费用和流程外，还有一些问题需要公司特别注意。首先，公司需要开具合法的发票，因为只有开具发票才能保障公司的利益。其次，公司需要了解税务政策，如营业税、增值税、企业所得税等，并在法定期限内上交税款，以避免产生欠税，影响公司的信誉和发展。好在公司可以雇佣专业的会计来代为处理税务事宜。同时，公司也要了解法律法规，在进行业务活动时，要遵守相关法律法规，防止不法分子以此牟取私利。此外，公司还需了解各种保险，如工商保险、雇主责任保险、财产险等，以保护公司的资产和员工的权益。总之，注册深圳公司需要注意诸多问题，需要公司谨慎选择，认真办理，以确保公司健康发展。