深圳企业注册的流程相对比较简单，费用也不会很高昂，但是如果您想要同时注册两个公司的话，就需要留意以下几点:
第一，公司之间的业务不要产生冲突。如果您同时注册两个公司，并且它们的业务范围有所重叠，那么就需要查看深圳市工商局的规定，确保不会产生法律冲突。
第二，合法合规。注册公司需要遵守深圳市及国家的相关法律法规，尤其是合同法、招聘法和税务法等方面。注册公司时需要仔细了解这些法律法规，以避免违法和不合规的情况。
第三，注册资金。深圳企业注册时需要注明注册资金，而且不同类型的公司资金要求也不同。同时注册两个公司时，需要确定每个公司的注册资金，以便资金的分配、利润的分配等。
第四，人力资源。创办两个公司需要足够的人力资源，包括管理人员、专业技术人员、工人等，以确保公司能够正常运营。
第五，执照和证件。每个公司都需要注册营业执照、税务登记证、组织机构代码证、开户许可证等证件，需要确保每个公司的证件齐全、准确、有效。
总之，注册两个公司可以提高企业的市场竞争力，但在注册时需要注意一系列问题，以确保公司能够合法合规地运营和发展。