深圳公司注册的流程并不复杂，并且相比其他城市，费用也相对较低。在注册公司时，需要提交一些资料，如公司设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或自然人股东身份证、代理人身份证以及住所使用证明。
除此之外，还会涉及一些其它的费用，如核名费、商务挂靠地址费、刻章费、做账报税费和银行开户费。其中，核名费是免费的，商务挂靠地址费从900元起每年收取，刻章费在注册时是免费的，但如果变更公司名称需要换章，则需要支付200-500元不等。做账报税的收费各家公司不统一，一般小规模企业都是一年2000元左右，一般纳税人则为5000-6000元每年。至于银行开户，银行不收取费用，不过找代办公司需要支付跑腿费。
不得不说，注册公司的费用相对较低，但还是有一些需要注意的问题。首先，很多人不知道如何注册公司，因此需要找代理公司帮忙，其中跑腿费也是需要支付的；其次，注册公司之后还需要做账报税，并且银行每年都会收取一定的账户管理费，所以这些费用也需要考虑进去。
综上所述，深圳公司注册相对简单，费用相对较低，但仍需注意相关费用和流程，并且尽可能选择一家专业的注册公司进行操作。