在深圳，外资公司注册也需要依照相关规定进行办理，以确保公司注册的合法性。首先，注册公司的资本要求不同于国内公司，外资公司的注册资本要求较高，而且公司注册时需要提供各种资料和证明文件，包括公司设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或自然人股东身份证以及复印件、代理人身份证以及复印件、住所使用证明等。
此外，外资公司注册还需要注意公司名称的选择，公司名称必须符合相关法规要求，并通过工商部门的核名程序。核名是免费的，但可能需要将公司名称与行业规范进行比较，以确保公司名称不会侵犯他人的商标或专利权。
在注册过程中，外资公司还需要选择商务挂靠地址。商务挂靠地址是一个虚拟的地址，为外资公司提供办公场所，用于注册和营业。商务挂靠地址通常由代理公司提供，费用在900元以上。
注册外资公司时，还需要进行公章的刻制。但是，在深圳注册公司，刻章是免费的，工商局会直接把单据发给附近的刻章店，大概3个小时就能收到，然后再发给企业。需要注意的是，如果是变更公司名称要换章，就需要自费了，一般在200-500元不等，主要是看换章的个数。
同时，注册外资公司后需要做账报税，这也是一笔费用。做账报税的费用因公司规模不同而不同，小规模的做账公司一年大约需要2000元，而一般纳税人需要5000-6000元。此外，银行开户也需要注意，开户手续繁琐，需要付出时间和精力。一些代理公司会代为处理银行开户手续，因此会收取额外的跑腿费。
总的来说，外资公司注册涉及到多个方面的规定和费用，需要认真审查，以确保注册公司的合法性和一切开支的公开透明。