在深圳注册公司的流程并不复杂，费用也不高，并没有深圳小产权房是否影响公司注册这个问题。一般来说，注册公司的费用在500元左右，有些公司可能会有优惠活动，价格可能会更低一些。除此之外，还会涉及到核名、商务挂靠地址、刻章、做账报税以及银行开户等费用。其中，刻章是免费的，银行开户也不收费，但是去银行开户的跑腿费需要自己承担。做账报税的价格因公司规模和需求的不同而异，而银行每年会收取一定的账户管理费。所需要的材料包括公司设立登记申请书、公司章程、股东身份证明、代理人身份证以及住所使用证明等。注册公司的过程并不会受到深圳小产权房的影响。