在中国，未成年人的法律地位相对较低，因此在某些事项上受到限制。对于注册深圳公司是否合法，年龄也是一个因素。因为根据《中华人民共和国未成年人保护法》规定，在未满18周岁的未成年人，以及18周岁以上但未满法定劳动年龄的未成年人，可根据其年龄、智力、行为能力等情况作出恰当的限制行为能力措施。
那么，对于16岁的未成年人，能否注册深圳公司呢？理论上讲，任何16岁以上、拥有完全民事行为能力的人都可以注册公司。但是，在实际操作中，16岁的未成年人申请注册公司还是比较困难的。首先，16岁的未成年人在财务、税务等方面不够成熟，不懂得企业经营管理等知识，容易出现失误。其次，由于未成年人无法独立签署法律文件，导致工商局和银行等机构可能无法为其开立相关账户，从而影响公司运作。
所以，对于想要在16岁时注册深圳公司的未成年人来说，需要更多的准备和规划。首先，要学习企业经营管理的知识，增强自身的经验和能力。其次，要得到家长或监护人的支持和帮助，在办理注册公司的过程中获得更多的帮助和指导。此外，还需要在财务、税务等各个方面提前做好规划，确保公司能够正常运作，并追求长期发展。
总之，在注册深圳公司时，无论是未成年人还是成年人，都需要遵守相关法律法规，了解注册流程和费用，准备好所需要的材料，选好合适的注册公司服务机构，才能顺利完成注册和开展业务。未成年人要注册公司，需要特别注意自身能力和法律限制，不能盲目行动，必须从现实出发，循序渐进，稳步推进。