深圳公司注册的流程相对来说不算复杂，但是在注册时需要注意很多事项以避免未来的麻烦。在注册公司时需要提交的资料一般包括公司设立登记申请书、公司章程以及法人股东资格证明或自然人股东身份证的复印件等。但是除了这些常规的资料外，还有一些费用需要我们特别注意。
首先是商务挂靠地址，这个费用一年在900元以上，不过这并非是必须的费用，如果公司已经有了自己的办公室，就可以不用再支付这笔费用了。另外需要特别注意的是银行开户费用，虽然银行开户本身是免费的，但是如果找代办公司帮忙，则需要支付一定的跑腿费用，因此这个费用需要根据实际情况来进行考虑。
而在注册公司之后，很多公司需要进行做账报税，此时的费用也需要格外关注。由于各个公司的收费并没有统一的标准，因此建议在选择做账公司时需要格外慎重，不要盲目选取便宜的公司，以免赚小便宜反而招来大麻烦。在一般纳税人记账报税时，一年的花费差不多在5000-6000元左右，而对于那些需要开票或经常外出处理事务的公司来说，花费会更高一些。
在进行注册公司时，还需要注意有关刻章和核名的事项。对于在深圳注册的公司，刻章一般是免费的，工商局会直接把单子发给附近的刻章店，三个小时后就能收到章了。但是如果是变更公司名称需要重新换章的话，则需要自行付费，一般在200-500元不等。而核名则是全免费的，无需任何费用。
最后，如果公司不再运营，需要进行注销，银行账户也需要一并被注销以避免不必要的欠费。因此，在注册公司时需要格外注意这些费用，并采取相应的措施以避免产生不必要的损失。