深圳作为一个中国著名的特区城市，一直以来都是吸引外商投资的热门城市之一。相比于其他城市，深圳的注册公司流程并不复杂，费用也不算高，但是仍然有一些需要注意的问题。
首先，注册公司的费用并不是工商局登记注册时需要收费的，而是指许多人在不知道如何注册公司时找代办公司帮忙代办的跑腿费。一般来说，注册公司的费用大约在500元左右，有些公司还会有优惠活动，费用可能会更加便宜。但是注册公司之后，需要做账报税，因此一些公司只收取做账报税的费用，注册费通常是免费赠送的。
其次，注册公司还会涉及到一些其他的费用，例如核名费、商务挂靠费、刻章费和银行开户费等。其中，核名费是免费的，商务挂靠费通常是900元起/年，刻章费是免费的，而银行开户费则是需要支付代办公司的跑腿费。需要注意的是，如果公司发生变更需要更换章，就需要自行支付更换章的费用，一般在200~500元不等，具体费用取决于更换章的数量。
做账报税的收费各个公司都没有统一价，小规模的公司通常一年收费大约在2000元左右，而一般纳税人则需要支付更高的费用，在5000~6000元左右。如果公司需要经常外出处理事务或者需要开票，费用也会更高。
最后，注册公司所需的材料包括公司设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件、代理人身份证及其复印件以及住所使用证明。需要准备的材料相对比较简单，大多数是常见的证明文件。
总之，在注册深圳分公司时，需要注意以上这些费用和材料所涉及到的问题，建议选择正规的代办公司来处理相关手续，避免因为无谓的差错和纠纷带来不必要的麻烦和费用损失。