深圳市出口公司的注册流程并不是特别复杂，但是在注册过程中有一些问题需要特别注意。
首先，需要注意注册费用。一般来说，注册公司的费用并不高，但是一些代办公司会收取跑腿费用，所以要提前了解清楚。通常情况下，注册公司的费用在500元左右，但是如果公司有优惠活动，费用可能会更低。
其次，需要考虑商务挂靠地址的问题。在深圳注册公司，商务挂靠地址是必须的，费用一般从900元起，按照年计算。
再次，需要申请公司的印章。在深圳注册公司，印章是免费申请的，工商局会直接将单子发给附近的刻章店。但是如果需要变更公司名称或印章数量，就需要自己付费了，这可能需要花费200-500元不等的费用。
最后，注册公司还需要准备一些材料，包括公司设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件、代理人身份证及其复印件、住所使用证明等。
需要特别注意的是，注册公司后还需要做账报税和去银行开户等事项。做账报税的收费因不同的公司而异，但一年的费用一般在2000元左右。银行开户是免费的，但如果需要找代办公司帮忙，可能会收取跑腿费。
总的来说，在注册深圳市出口公司时，需要特别注意以上几个问题。只有做好这些准备工作，才能让注册流程更加顺利。