深圳的微企公司注册流程并不复杂，因此费用也比较便宜。注册费用并不是指工商局登记注册费用，而是很多人不知道如何注册公司，需要找代办公司帮忙代办，因此需要支付一些跑腿费用。
通常情况下，注册公司的费用在500元左右。有些公司可能会有优惠活动，费用会更加优惠。此外，很多公司会在注册之后免费赠送做账报税服务，这也是需要支付费用的服务项目。
除了上述费用之外，注册公司还需要支付以下费用：
1. 核名费用：免费。
2. 商务挂靠地址费用：900元以上/年。
3. 刻章费用：免费。深圳工商局会直接将申请单送至附近的刻章店，一个章的制作时间为3个小时左右。
4. 做账报税费用：每个公司的收费标准不同，一般小规模公司的费用在2000元左右，一般纳税人公司的费用在5000-6000元左右。
5. 银行开户费用：去银行开户是不需要支付费用的，但如果找代办公司帮忙则需要支付跑腿费用。银行账户每年会收取一定的账户管理费用。
如果公司要注销，需要记得一并去银行注销账户，以免产生欠费。注册公司需要提交以下材料：公司设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或自然人股东身份证及其复印件、代理人身份证及其复印件、住所使用证明。
总的来说，深圳微企公司注册的费用相对较低，但是还是需要根据实际情况做出综合考虑。