在深圳注销运输公司，需要经过以下步骤：
第一步：选择公司类型
深圳注册公司可以选择有限责任公司、股份有限公司等。不同类型的公司需要提供不同的材料和手续。需要根据自己的实际情况来选择合适的公司类型。
第二步：核名
在深圳市工商局网站上进行在线申请核名，公司名称必须符合规定并且不存在与其他注册公司名称相同的情况。
第三步：提交材料
核名通过后，在规定时间内将相关材料提交给深圳市工商局，包括设立登记申请书、公司章程、法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件、代理人身份证及其复印件、住所使用证明等。
第四步：缴纳费用
在提交材料之前，需要缴纳不同类型公司的注册费用。一般来说，注册费用在500元左右，不同公司类型的费用会有所不同。
第五步：领取营业执照和组织机构代码证
深圳市工商局审核通过后，可以领取营业执照和组织机构代码证。营业执照是企业法人的身份证明，组织机构代码证是企业组织机构的身份证明。
第六步：刻制公章
刻制公章需要提供营业执照、组织机构代码证以及法定代表人身份证原件，到指定地点交费后3小时左右即可领取。
第七步：银行开户
企业需要到银行开立企业账户，并使用公章验资。开户时需要提供营业执照、组织机构代码证、法定代表人身份证等材料。开户成功后，需要将资金注入到企业账户中。
第八步：税务登记
企业注册成功后，需要到税务部门进行税务登记。在税务登记时需要提供企业的基本信息、营业执照、组织机构代码证等材料。
如果企业需要在经营过程中进行一些变更，例如公司名称变更、股东变更、法定代表人变更等，也需要到深圳市工商局进行相应的变更手续。
总之，深圳注册公司的流程并不复杂，只要逐步完成以上步骤，就可以成功注册开办一家运输公司。